【タンパク質科学】研究で役立つデータベース集

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きりさめ

きりさめ

修士卒会社員【専門】生化学、生命科学【趣味】映画、読書、散歩【一言】レオパードゲッコーの男の子と住んでます。愛が止まらない・・・。

論文学習や研究に使えるデータベース、リンク集をまとめました。「こんなのも使ってるよ!」という方がいらっしゃいましたらTwitterまでよろしくお願い致します。

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英語学習

無償のオンライン辞書サービス。英和・和英の対訳を調べるだけでなく、発音や用法、共起表現の検索も行うことができる。

 

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統合データベース

米国立バイオテクノロジー情報センターが運用する統合データベース。

 

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文献データベース

アメリカ国立医学図書館が運用する無料の文献検索サービス。生命科学、生物医学などの書誌情報を検索することができる。

有償。科学技術振興機構(JST)が作成し、株式会社ジー・サーチが提供する科学技術や医学などのデータベースである。文献の検索や取り寄せ、分析・調査依頼ができる。

 

塩基配列のデータベース

  • DDBJ
    http://www.ddbj.nig.ac.jp/
    国立遺伝研究所が管理しているデータベース。上位機関は「大学共同利用機関」である。

 

タンパク質のデータベース

タンパク質、核酸などに関する、実験に基づいたデータベース。国際タンパク質構造データバンクが運営している。

国際タンパク質構造データバンクのグループである日本蛋白質構造データバンクが運営している。PDBのアーカイブおよび様々な解析ツールの提供を行っている。

既知のシグナル配列を学習し、シグナル配列の位置を予測するツール。

細胞内局在を予測するツール。

スイスバイオインフォマティクス研究所(SIB:Swiss Institute of Bioinformatics)の運営するデータベース。タンパク質の一次配列を基に解析できる。予想される二次構造の計算、組換えタンパク質の等電点や分子量の計算などができる。

 

生物のデータベース

モデル生物であるシロイヌナズナについて遺伝学的データ、分子生物学データなどが掲載されている。

微生物ゲノムの比較分析のためのデータベース。

ウィスコンシン大学マディソン校のE.coli K-12株のゲノムプロジェクト。

Saccharomyces cerevisiaeのゲノム、タンパク質情報が掲載されたデータベース。

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